Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf1P39428 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Traf1P39428 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Traf1P39428 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf1P39428 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Traf1P39428 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms