Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tfap2aP34056 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfap2aP34056 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms