Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnd1P30999 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnnd1P30999 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms