Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9P28357 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Hoxd9P28357 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9P28357 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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