Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defa2P28309 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa2P28309 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms