Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmo2P25801 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmo2P25801 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms