Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Znf239P24399 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Znf239P24399 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms