Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria1P23818 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gria1P23818 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gria1P23818 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms