Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PrkceP16054 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkceP16054 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms