Protein–RNA interactions for Protein: P15307

Rel, Proto-oncogene c-Rel, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelP15307 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RelP15307 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RelP15307 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RelP15307 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RelP15307 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RelP15307 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RelP15307 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RelP15307 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RelP15307 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RelP15307 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RelP15307 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RelP15307 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelP15307 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelP15307 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelP15307 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RelP15307 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RelP15307 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelP15307 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RelP15307 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RelP15307 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelP15307 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RelP15307 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms