Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctla2aP12399 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctla2aP12399 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms