Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DmdP11531 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DmdP11531 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DmdP11531 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DmdP11531 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DmdP11531 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DmdP11531 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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