Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem254aP0DN89 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms