Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Prm2P07978 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Prm2P07978 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.7 ms