Protein–RNA interactions for Protein: P01803

Ig heavy chain V region AMPC1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01803 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01803 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01803 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01803 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01803 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01803 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01803 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01803 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01803 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01803 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01803 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01803 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01803 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01803 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01803 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01803 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01803 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01803 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01803 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01803 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01803 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
P01803 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01803 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01803 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01803 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01803 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01803 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
P01803 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01803 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01803 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms