Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capn6O35646 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn6O35646 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn6O35646 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn6O35646 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn6O35646 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms