Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-ObO35424 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms