Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArxO35085 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArxO35085 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArxO35085 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArxO35085 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArxO35085 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArxO35085 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArxO35085 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArxO35085 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArxO35085 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArxO35085 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArxO35085 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArxO35085 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArxO35085 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArxO35085 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArxO35085 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArxO35085 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArxO35085 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArxO35085 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArxO35085 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArxO35085 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArxO35085 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArxO35085 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArxO35085 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArxO35085 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArxO35085 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArxO35085 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ArxO35085 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArxO35085 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArxO35085 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArxO35085 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms