Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MsmbO08540 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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