Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al1oL7MU04 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al1oL7MU04 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms