Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21411J3KMS0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21411J3KMS0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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