Protein–RNA interactions for Protein: D3YZU1

Shank1, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank1D3YZU1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shank1D3YZU1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank1D3YZU1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms