Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms