Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF879B4DU55 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms