Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CFAP73A6NFT4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CFAP73A6NFT4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms