Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klhl41A2AUC9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms