Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cldn18P56857 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cldn18P56857 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cldn18P56857 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn18P56857 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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