Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Tmem63c-201ENSMUST00000110187 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm37673-201ENSMUST00000194880 2451 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 AC154461.2-201ENSMUST00000225462 1980 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm16316-201ENSMUST00000154065 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Siglech-202ENSMUST00000094360 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm43465-201ENSMUST00000200367 2802 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Slco2b1-203ENSMUST00000107088 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm26785-201ENSMUST00000181775 2914 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Zfp658-202ENSMUST00000107972 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Gm2233-201ENSMUST00000222566 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Zfat-202ENSMUST00000160248 3866 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Ptbp3-210ENSMUST00000173699 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sox12Q04890 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms