Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp5Q9Z131 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp5Q9Z131 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms