Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn15Q9Z0S5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn15Q9Z0S5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn15Q9Z0S5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cldn15Q9Z0S5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn15Q9Z0S5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms