Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VapaQ9WV55 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapaQ9WV55 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms