Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gpc6Q9R087 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gpc6Q9R087 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gpc6Q9R087 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gpc6Q9R087 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gpc6Q9R087 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gpc6Q9R087 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gpc6Q9R087 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gpc6Q9R087 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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