Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Copg1Q9QZE5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copg1Q9QZE5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms