Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chaf1aQ9QWF0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chaf1aQ9QWF0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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