Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap1s2Q9DB50 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ap1s2Q9DB50 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms