Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAE8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAE8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms