Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rep15Q9D7T1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rep15Q9D7T1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rep15Q9D7T1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rep15Q9D7T1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rep15Q9D7T1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rep15Q9D7T1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rep15Q9D7T1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rep15Q9D7T1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rep15Q9D7T1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rep15Q9D7T1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rep15Q9D7T1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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