Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PudpQ9D5U5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PudpQ9D5U5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms