Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Syf2Q9D198 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syf2Q9D198 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms