Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3bQ9CZT8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab3bQ9CZT8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms