Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mis12Q9CY25 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms