Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo1Q9CXH7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Sgo1Q9CXH7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Sgo1Q9CXH7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sgo1Q9CXH7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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