Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmed5Q9CXE7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms