Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
4930519P11RikQ9CUJ8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930519P11RikQ9CUJ8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms