Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rprd1bQ9CSU0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms