Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rer1Q9CQU3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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