Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms