Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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