Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd49Q8VE42 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd49Q8VE42 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd49Q8VE42 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd49Q8VE42 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd49Q8VE42 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd49Q8VE42 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd49Q8VE42 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd49Q8VE42 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd49Q8VE42 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd49Q8VE42 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd49Q8VE42 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms