Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mterf3Q8R3J4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mterf3Q8R3J4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms